Uma das teorias sobre a sua criação envolve os nomes de John Wharton e William Morrison, dois fabricantes de doces de Nashville (Tennessee). Eles inventaram uma máquina com uma bacia giratória e pequenos buracos com a qual fizeram os primeiros algodões doces. Esta máquina, patenteada em 1899, é capaz de transformar açúcar em fios com textura de algodão.
Há quem diga que a origem do algodão doce está na Itália, país onde no século XV aquecia-se o açúcar para obter um fio bem fino para decorar os doces e bolos feitos pelos confeiteiros. Pode ter sido esta técnica a que inspirou William Morrison e John C a desenvolver o algodão doce que conhecemos atualmente.